MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 40374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021738	GCT	2	6	242638	242643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655921
4002	NC_021738	CT	3	6	242674	242679	0 %	50 %	0 %	50 %	525655921
4003	NC_021738	GCG	2	6	242712	242717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655921
4004	NC_021738	TAA	2	6	242733	242738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655921
4005	NC_021738	ACT	2	6	242782	242787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655921
4006	NC_021738	CTA	2	6	242843	242848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655921
4007	NC_021738	CAA	2	6	242891	242896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655921
4008	NC_021738	ACA	2	6	243142	243147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655921
4009	NC_021738	A	6	6	243162	243167	100 %	0 %	0 %	0 %	525655921
4010	NC_021738	CTT	2	6	243221	243226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655921
4011	NC_021738	A	6	6	243294	243299	100 %	0 %	0 %	0 %	525655921
4012	NC_021738	TAA	2	6	243338	243343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655921
4013	NC_021738	TGA	2	6	243411	243416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655921
4014	NC_021738	ACCA	2	8	243691	243698	50 %	0 %	0 %	50 %	525655922
4015	NC_021738	GCC	2	6	243776	243781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655922
4016	NC_021738	CTA	2	6	243804	243809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655922
4017	NC_021738	ATT	2	6	243859	243864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655922
4018	NC_021738	ACT	2	6	243898	243903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655922
4019	NC_021738	TGT	2	6	243922	243927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655922
4020	NC_021738	TTTTG	2	10	244035	244044	0 %	80 %	20 %	0 %	525655922
4021	NC_021738	A	8	8	244093	244100	100 %	0 %	0 %	0 %	525655923
4022	NC_021738	ACT	2	6	244117	244122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655923
4023	NC_021738	GCT	2	6	244238	244243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655923
4024	NC_021738	A	6	6	244245	244250	100 %	0 %	0 %	0 %	525655923
4025	NC_021738	ATA	2	6	244260	244265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655923
4026	NC_021738	GGT	2	6	244289	244294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655923
4027	NC_021738	GAAT	2	8	244377	244384	50 %	25 %	25 %	0 %	525655923
4028	NC_021738	TC	3	6	244444	244449	0 %	50 %	0 %	50 %	525655923
4029	NC_021738	TAA	2	6	244498	244503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655923
4030	NC_021738	A	7	7	244502	244508	100 %	0 %	0 %	0 %	525655923
4031	NC_021738	AAC	2	6	244579	244584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655923
4032	NC_021738	A	6	6	244657	244662	100 %	0 %	0 %	0 %	525655923
4033	NC_021738	ACGT	2	8	244698	244705	25 %	25 %	25 %	25 %	525655923
4034	NC_021738	TGA	2	6	244846	244851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655923
4035	NC_021738	TTG	2	6	244950	244955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655923
4036	NC_021738	AATT	2	8	245007	245014	50 %	50 %	0 %	0 %	525655923
4037	NC_021738	A	8	8	245026	245033	100 %	0 %	0 %	0 %	525655923
4038	NC_021738	A	6	6	245039	245044	100 %	0 %	0 %	0 %	525655923
4039	NC_021738	A	6	6	245117	245122	100 %	0 %	0 %	0 %	525655923
4040	NC_021738	TTA	2	6	245177	245182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655923
4041	NC_021738	CAA	2	6	245210	245215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655923
4042	NC_021738	CGG	2	6	245287	245292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655923
4043	NC_021738	GAA	2	6	245309	245314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655923
4044	NC_021738	TAA	2	6	245319	245324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655923
4045	NC_021738	CAC	2	6	245410	245415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655923
4046	NC_021738	AAG	2	6	245427	245432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655923
4047	NC_021738	TGG	2	6	245578	245583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655923
4048	NC_021738	A	6	6	245603	245608	100 %	0 %	0 %	0 %	525655923
4049	NC_021738	A	6	6	245654	245659	100 %	0 %	0 %	0 %	525655923
4050	NC_021738	TTC	2	6	245660	245665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655923
4051	NC_021738	GAA	2	6	245666	245671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655923
4052	NC_021738	ATT	2	6	245678	245683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655923
4053	NC_021738	A	6	6	245704	245709	100 %	0 %	0 %	0 %	525655923
4054	NC_021738	TTC	2	6	246160	246165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655924
4055	NC_021738	TAAA	2	8	246279	246286	75 %	25 %	0 %	0 %	525655924
4056	NC_021738	GCA	2	6	246406	246411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655924
4057	NC_021738	TTG	2	6	246477	246482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655924
4058	NC_021738	CAC	2	6	246566	246571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655924
4059	NC_021738	TCT	2	6	246583	246588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655924
4060	NC_021738	GAT	2	6	246689	246694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655924
4061	NC_021738	CCT	2	6	246718	246723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525655924
4062	NC_021738	ACTC	2	8	246759	246766	25 %	25 %	0 %	50 %	525655924
4063	NC_021738	TCA	2	6	246826	246831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655924
4064	NC_021738	T	6	6	246838	246843	0 %	100 %	0 %	0 %	525655924
4065	NC_021738	ACC	2	6	246885	246890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655924
4066	NC_021738	TTG	2	6	246903	246908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655924
4067	NC_021738	TTC	2	6	246972	246977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655924
4068	NC_021738	TAA	2	6	246987	246992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655924
4069	NC_021738	GTT	2	6	247017	247022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655924
4070	NC_021738	GTT	2	6	247153	247158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655925
4071	NC_021738	T	6	6	247177	247182	0 %	100 %	0 %	0 %	525655925
4072	NC_021738	TAAAT	2	10	247230	247239	60 %	40 %	0 %	0 %	525655925
4073	NC_021738	ATTA	2	8	247307	247314	50 %	50 %	0 %	0 %	525655925
4074	NC_021738	TG	3	6	247354	247359	0 %	50 %	50 %	0 %	525655925
4075	NC_021738	TTC	2	6	247415	247420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655925
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4077	NC_021738	ATT	2	6	247496	247501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655925
4078	NC_021738	TCT	2	6	247551	247556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655925
4079	NC_021738	AGA	2	6	247568	247573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655925
4080	NC_021738	TTC	2	6	247613	247618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655925
4081	NC_021738	AAC	2	6	247619	247624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655925
4082	NC_021738	TAT	2	6	247753	247758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655925
4083	NC_021738	AGC	3	9	247922	247930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655925
4084	NC_021738	TCT	2	6	247936	247941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655925
4085	NC_021738	TGT	2	6	247959	247964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655925
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4088	NC_021738	CAC	2	6	248039	248044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655926
4089	NC_021738	T	6	6	248048	248053	0 %	100 %	0 %	0 %	525655926
4090	NC_021738	TTG	2	6	248061	248066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655926
4091	NC_021738	GGA	2	6	248104	248109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525655926
4092	NC_021738	ATC	2	6	248150	248155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655926
4093	NC_021738	TCATCT	2	12	248178	248189	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525655926
4094	NC_021738	TCA	2	6	248196	248201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655926
4095	NC_021738	CTGG	2	8	248215	248222	0 %	25 %	50 %	25 %	525655926
4096	NC_021738	TTC	2	6	248243	248248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655926
4097	NC_021738	AAT	2	6	248259	248264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655926
4098	NC_021738	T	6	6	248297	248302	0 %	100 %	0 %	0 %	525655926
4099	NC_021738	ACATT	2	10	248329	248338	40 %	40 %	0 %	20 %	525655926
4100	NC_021738	T	6	6	248405	248410	0 %	100 %	0 %	0 %	525655926
4101	NC_021738	GCGA	2	8	248417	248424	25 %	0 %	50 %	25 %	525655926
4102	NC_021738	TGG	2	6	248429	248434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655926
4103	NC_021738	ATC	2	6	248450	248455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655926
4104	NC_021738	T	6	6	248764	248769	0 %	100 %	0 %	0 %	525655927
4105	NC_021738	CTT	2	6	248773	248778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655927
4106	NC_021738	ATT	2	6	248801	248806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655927
4107	NC_021738	AAG	2	6	248811	248816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655927
4108	NC_021738	ATT	2	6	248843	248848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655927
4109	NC_021738	TAC	2	6	248968	248973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655927
4110	NC_021738	GGT	2	6	249001	249006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655927
4111	NC_021738	AAATC	2	10	249042	249051	60 %	20 %	0 %	20 %	525655927
4112	NC_021738	ATT	2	6	249098	249103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655927
4113	NC_021738	ACA	2	6	249111	249116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655927
4114	NC_021738	TAA	2	6	249131	249136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655927
4115	NC_021738	GGC	2	6	249175	249180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655927
4116	NC_021738	TTC	2	6	249183	249188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655927
4117	NC_021738	TGCT	2	8	249239	249246	0 %	50 %	25 %	25 %	525655927
4118	NC_021738	TCA	2	6	249441	249446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655927
4119	NC_021738	AAT	2	6	249500	249505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655927
4120	NC_021738	GGC	2	6	249514	249519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655927
4121	NC_021738	GAA	2	6	249588	249593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655927
4122	NC_021738	T	6	6	249646	249651	0 %	100 %	0 %	0 %	525655927
4123	NC_021738	CA	3	6	249728	249733	50 %	0 %	0 %	50 %	525655927
4124	NC_021738	GAC	2	6	249742	249747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655927
4125	NC_021738	TCA	2	6	249771	249776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655927
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4127	NC_021738	GCCTC	2	10	249868	249877	0 %	20 %	20 %	60 %	525655927
4128	NC_021738	TTG	2	6	249878	249883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655927
4129	NC_021738	AAT	2	6	249890	249895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655927
4130	NC_021738	ATTG	2	8	249947	249954	25 %	50 %	25 %	0 %	525655927
4131	NC_021738	ACC	2	6	249978	249983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655927
4132	NC_021738	TCA	2	6	250080	250085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655927
4133	NC_021738	CT	3	6	250202	250207	0 %	50 %	0 %	50 %	525655927
4134	NC_021738	TGA	2	6	250220	250225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655927
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4136	NC_021738	CGG	2	6	250506	250511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655928
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4138	NC_021738	AT	3	6	250573	250578	50 %	50 %	0 %	0 %	525655928
4139	NC_021738	CGA	2	6	250582	250587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655928
4140	NC_021738	ATT	2	6	250613	250618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655928
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4144	NC_021738	A	6	6	250707	250712	100 %	0 %	0 %	0 %	525655928
4145	NC_021738	ACCA	2	8	250732	250739	50 %	0 %	0 %	50 %	525655928
4146	NC_021738	A	6	6	250742	250747	100 %	0 %	0 %	0 %	525655928
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4152	NC_021738	CACTG	2	10	251190	251199	20 %	20 %	20 %	40 %	525655929
4153	NC_021738	TCCAT	2	10	251263	251272	20 %	40 %	0 %	40 %	525655929
4154	NC_021738	TAA	2	6	251303	251308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655929
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4167	NC_021738	AAAG	2	8	251798	251805	75 %	0 %	25 %	0 %	525655929
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4231	NC_021738	TCTT	2	8	255074	255081	0 %	75 %	0 %	25 %	525655931
4232	NC_021738	TCA	2	6	255128	255133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655931
4233	NC_021738	AAT	2	6	255286	255291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655931
4234	NC_021738	TCA	2	6	255302	255307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655931
4235	NC_021738	ATC	2	6	255323	255328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655931
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4237	NC_021738	TTC	2	6	255440	255445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655931
4238	NC_021738	TCATAT	2	12	255471	255482	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525655931
4239	NC_021738	GTC	2	6	255509	255514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655931
4240	NC_021738	CACAAT	2	12	255565	255576	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525655931
4241	NC_021738	TCA	2	6	255602	255607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655931
4242	NC_021738	CCA	2	6	255618	255623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655931
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4244	NC_021738	AAT	2	6	255664	255669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655931
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4489	NC_021738	TGGC	2	8	269172	269179	0 %	25 %	50 %	25 %	525655941
4490	NC_021738	TAT	2	6	269194	269199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655941
4491	NC_021738	AAT	2	6	269257	269262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655941
4492	NC_021738	CAC	2	6	269269	269274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655941
4493	NC_021738	TGG	2	6	269282	269287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655941
4494	NC_021738	AATG	2	8	269359	269366	50 %	25 %	25 %	0 %	525655941
4495	NC_021738	CTG	2	6	269407	269412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655941
4496	NC_021738	TGAC	2	8	269448	269455	25 %	25 %	25 %	25 %	525655941
4497	NC_021738	CGAG	2	8	269456	269463	25 %	0 %	50 %	25 %	525655941
4498	NC_021738	AAC	2	6	269521	269526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655941
4499	NC_021738	GGCTAA	2	12	269528	269539	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525655941
4500	NC_021738	AGGTA	2	10	269555	269564	40 %	20 %	40 %	0 %	525655941

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